Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp19Q3UJD6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp19Q3UJD6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms