Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Fam117bQ3U3E2 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Fam117bQ3U3E2 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Fam117bQ3U3E2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Fam117bQ3U3E2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fam117bQ3U3E2 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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