Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RubcnlQ3TD16 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RubcnlQ3TD16 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms