Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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