Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ptcd3Q14C51 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms