Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim24Q0VG18 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms