Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms