Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms