Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfdn6Q03958 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pfdn6Q03958 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn6Q03958 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn6Q03958 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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