Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms