Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms