Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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