Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mesp1P97309 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms