Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Arf1P84078 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms