Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbdP63072 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbdP63072 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbdP63072 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms