Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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