Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PctpP53808 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PctpP53808 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms