Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FmodP50608 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms