Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxc13P50207 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxc13P50207 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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