Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl11P48298 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms