Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KdrP35918 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KdrP35918 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KdrP35918 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KdrP35918 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KdrP35918 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KdrP35918 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms