Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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VtnP29788 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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VtnP29788 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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VtnP29788 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
VtnP29788 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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