Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PparaP23204 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PparaP23204 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PparaP23204 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PparaP23204 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PparaP23204 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PparaP23204 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms