Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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