Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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