Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms