Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pou4f1P17208 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms