Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb1P12658 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms