Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01798 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01798 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01798 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01798 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01798 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01798 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01798 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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