Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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