Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Taf4bG5E8Z2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms