Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms