Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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