Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trabd2bB1ATG9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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