Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm2A2A7B5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms