Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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