Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn8Q9Z260 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn8Q9Z260 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms