Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Psma1Q9R1P4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms