Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SrfQ9JM73 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SrfQ9JM73 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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