Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Tgm1Q9JLF6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tgm1Q9JLF6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms