Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rb1cc1Q9ESK9 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms