Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl4Q9DCU6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms