Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxp4Q9DBY0 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms