Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Usp12Q9D9M2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp12Q9D9M2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp12Q9D9M2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp12Q9D9M2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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