Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn22Q9D7U6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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