Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms