Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NubplQ9CWD8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms