Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg3Q9CPX6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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