Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rpl17Q9CPR4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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