Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Hdac9Q99N13 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hdac9Q99N13 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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